Νεα εγκατάσταση διανομής (π.χ. messy_2.42_src.zip)
1) Αποσυμπιέζουμε την διανομή σε κάποιο φάκελο. Αυτομάτα δημιουργειται νεός με το ονομα τησ διανομής. Στην προκείμενη περίπτωση messy_2.42
> unzip messy_2.42_src.zip
Archive: messy_2.42_src.zip
creating: messy_2.42/
creating: messy_2.42/echam5.3.02/
inflating: messy_2.42/echam5.3.02/README.NETCDF
...
messy_2.42/echam5.3.01/lapack -> ../echam5.3.02/lapack
2) πρεπει να εφαρμόζουμε τα patches. Για την διανομή 2.42 υπάρχουν 2 patches: patch_2.42_01, patch_2.42_02.
> patch -p0 < patch_2.42_01
(Stripping trailing CRs from patch.)
...
patching file MESSy2_CHANGELOG
> patch -p0 < patch_2.42_02
(Stripping trailing CRs from patch.)
...
patching file MESSy2_CHANGELOG
3) Xρησιμοποιούμε το σωστό mh- file στον φακελο config
Για το MISTRAL αν χρησιμοποιούμε τον GFORTRAN compiler το κατάλληλο mh-linux-64 μπορουμε να το κατεβάσουμε απο εδω.
4) O MISTRAL τρέχει SL6.2 και στον φάκελο /usr έχει δύο υποφακέλους με βιβλιοθήκες, lib και lib64. Το configuration file του MESSY έχει γραφετεί ώστε να καταλαβαίνει μόνο τον φάκελο lib. Ετσι αν πρόσπαθήσουμε να κάνουμε configure δεν θα δρεί την βιβλιοθήκη netcdf είναι εγκτεστημένη στον φακελο lib64. Εδώ έχει τον σωστο αρχείο configure.
5) configure
> ./configure --enable-PNETCDF=no
6) make
> gmake -j 4
Σε περιπτωση compile-time λάθους στο αρχειο typeSizes.f90
Για compile στο αρχειο ./libsrc/netcdf90 πρεπεί να προσθέσουμε την -fpp στο αρχειο makefile.m.
Αλλαζουμε το
$(F90) $(F90NOR8) -c typeSizes.f90 σε $(F90) $(F90NOR8) -cpp -c typeSizes.f90
και
$(F90) $(F90NOR8) -c netcdf.f90 σε $(F90) $(F90NOR8) -cpp -c netcdf.f90
7) DONT forget to add netcdf in LD_LIBRARY_PATH
> gmake list (τα αποτελέσμα εδώ)
8)Θα πρέπει α δημιουργήσουμε τα εργαλεία
> make tools
Δημιουργει στο \bin εργαλέια (π.χ. kpp, kp4) που χριάζονατι για να εκτελέσουμε το xconfig ωστε να δημιουργήσουμε νέο χημικό μηχανισμο.
1) Αποσυμπιέζουμε την διανομή σε κάποιο φάκελο. Αυτομάτα δημιουργειται νεός με το ονομα τησ διανομής. Στην προκείμενη περίπτωση messy_2.42
> unzip messy_2.42_src.zip
Archive: messy_2.42_src.zip
creating: messy_2.42/
creating: messy_2.42/echam5.3.02/
inflating: messy_2.42/echam5.3.02/README.NETCDF
...
messy_2.42/echam5.3.01/lapack -> ../echam5.3.02/lapack
> patch -p0 < patch_2.42_01
(Stripping trailing CRs from patch.)
...
patching file MESSy2_CHANGELOG
> patch -p0 < patch_2.42_02
(Stripping trailing CRs from patch.)
...
patching file MESSy2_CHANGELOG
3) Xρησιμοποιούμε το σωστό mh- file στον φακελο config
Για το MISTRAL αν χρησιμοποιούμε τον GFORTRAN compiler το κατάλληλο mh-linux-64 μπορουμε να το κατεβάσουμε απο εδω.
4) O MISTRAL τρέχει SL6.2 και στον φάκελο /usr έχει δύο υποφακέλους με βιβλιοθήκες, lib και lib64. Το configuration file του MESSY έχει γραφετεί ώστε να καταλαβαίνει μόνο τον φάκελο lib. Ετσι αν πρόσπαθήσουμε να κάνουμε configure δεν θα δρεί την βιβλιοθήκη netcdf είναι εγκτεστημένη στον φακελο lib64. Εδώ έχει τον σωστο αρχείο configure.
5) configure
> ./configure --enable-PNETCDF=no
6) make
> gmake -j 4
Σε περιπτωση compile-time λάθους στο αρχειο typeSizes.f90
Για compile στο αρχειο ./libsrc/netcdf90 πρεπεί να προσθέσουμε την -fpp στο αρχειο makefile.m.
Αλλαζουμε το
$(F90) $(F90NOR8) -c typeSizes.f90 σε $(F90) $(F90NOR8) -cpp -c typeSizes.f90
και
$(F90) $(F90NOR8) -c netcdf.f90 σε $(F90) $(F90NOR8) -cpp -c netcdf.f90
7) DONT forget to add netcdf in LD_LIBRARY_PATH
> gmake list (τα αποτελέσμα εδώ)
8)Θα πρέπει α δημιουργήσουμε τα εργαλεία
> make tools
Δημιουργει στο \bin εργαλέια (π.χ. kpp, kp4) που χριάζονατι για να εκτελέσουμε το xconfig ωστε να δημιουργήσουμε νέο χημικό μηχανισμο.
